Dalam video profil dijelaskan, SMA Kristen Pandegha Jaya berdiri dengan Visi : Mempersiapkan Calon Pemimpin yang Cakap, Berintegritas, Penuh Pengabdian dan Mencintai Bangsa.
SMA Kristen Pandegha Jaya mengintegrasikan 4 kurikulum yaitu Kurikulum Nasional, Kurikulum Kepepimpinan (Excellent Leader Training), Kurikulum Entrepreneurship, dan Kurikulum Pembelajaran Alkitab.
Sekolah ini juga menerapkan sekolah berasrama agar pembentukan karakter dan kedisiplinan dapat berlangsung lebih efektif.